特殊配方奶粉，就是在原有配方奶粉的基础上，增加一些针对性的配方元素，或是去除了一些成分，经过特殊工艺处理过的奶粉。有些情况下，妈妈无法母乳喂养，但是有的宝宝由于自身在消化、免疫或代谢上的一些问题，吃了一般的配方奶粉就会出现了各种不适的症状，这就需要合适的特殊配方奶粉。

特殊配方奶粉中，大多数都是无乳糖配方奶粉和水解蛋白奶粉。

• 无乳糖配方奶粉，又称防腹泻配方奶粉，奶粉配方中去掉了乳糖成份，大多数用麦芽糊精替代，可以减轻肠道的消化负担，避免乳糖不耐受导致的腹胀、腹泻等问题。
• 水解蛋白奶粉，也就经常说的防过敏配方奶粉，分为部分水解和完全水解两种，适用于有过敏体质的宝宝。这种奶粉在加工过程中，将牛乳中的蛋白质进一步水解成氨基酸，降低了牛奶蛋白的致敏性。

• 早产的宝宝：早产儿特殊配方奶粉，专门针对早产儿消化代谢和肾排泄功能差的生理特点设计的，特点为容易消化吸收及热量高。
• 容易溢奶的宝宝：防溢配方奶粉，适合常常出现溢奶情况的宝贝，这种配方奶粉实在奶粉中掺入了一些可溶性淀粉，使奶液较常规类的稠一些，流动更缓慢，在确保宝宝能吸收到足够营养成分的前提下，降低来自胃部的压缩感，有效抑制溢奶。
• 偏食的宝宝：偏食宝宝奶粉，这类奶粉加强了偏食宝宝常缺乏的营养素，可以帮助偏食宝宝获得全面和均衡的营养，但是不能完全代替普通奶粉，也不能代替日常膳食。
• 乳糖不耐受的宝宝：乳糖是牛奶中的一种糖，有些人先天性体内无法产生足够的用于分解乳糖的酶。那么，牛奶中的乳糖就不能被消化分解，从而导致腹胀、腹泻等消化系统症状。研究表明，当孩子发生腹泻时，小肠上皮细胞破损，也会导致暂时性乳糖酶缺乏。无乳糖配方奶粉就适合这类的孩子。
• 牛奶蛋白过敏的宝宝：水解蛋白奶粉在加工过程中，将牛乳中的蛋白质进一步水解成氨基酸，降低了牛奶蛋白的致敏性，因此适合牛奶蛋白过敏的宝宝食用。